1865年，此时的清朝刚刚平定太平天国运动，就在这时西北发生了一件大事，中亚的阿古柏在当时沙皇俄国的授意之下趁机入侵了我国的新疆，一时之间整个西北危急，中华民族危急。

为了夺回新疆，公元1876年，左宗棠抬棺出征，率兵出征新疆。

新疆的战略地位有多重要是不言而喻的，一旦丢失了新疆，那么西北、华北、内蒙等土地当时就都在列强的攻击范围之内，而我们就不得不花费更多的精力去抵消这些攻击，所以单凭这点来说，左宗棠的功绩确实是不可估量的，故而他也有着“晚清第一硬骨头”的说法。

不过当时左宗棠收复新疆可以说极为不容易，甚至可以说是凭借一己之力孤军奋战，因为清政府并没有给予左宗棠很多支持，左宗棠为此不得不抬棺出征以壮军心，为了解决新疆的军费，左宗棠直接找了英国人贷款，而英国人担心左宗棠失败这笔钱就会血本无归，故而在左宗棠收复新疆的时候大力支持。

左宗棠的这招驱虎吞狼让英国和沙俄不敢以武力支持，只能用各种手段想方设法的延缓左宗棠收复新疆，幸好左宗棠骁勇善战，经验丰富，在到达新疆之后就收复了北疆全境。

就在清军打算南下之际，阿古柏突然猝死，于1877年死在了喀拉沙尔。

阿古柏一死，新疆的叛军一下群龙无首，在这之后又经过一年多的血战左宗棠收复了新疆，阿古柏的妻儿最终结局如何呢？

在阿古柏死后，阿古柏的旧部就退居阿古柏的儿子伯克·胡里即位，然而，阿古柏本人都打不过左宗棠，更不用说他那儿子了，在左宗棠的指挥下，清军势如破竹很快收复了南疆，面对清军的铁蹄，伯克·胡里感觉到大事不妙便早早做好了打算，在这之后率领阿古柏一部分旧部回到了中亚老家，也有一种说法是他们投靠了俄国。

除了这个儿子之外，当时阿古柏在新疆还有7个儿子，2个孙子、2个孙女、4个妻子、同时因为阿古柏在新疆统治多年，其还有很多势力，要彻底根除阿古柏也是需要一番功夫的，在这之后左宗棠就开始对症下药：

阿古柏虽然有四个妻子，可是左宗棠审讯之后才知道，这4个妻子都是当时被阿古柏抢过来的汉族女子和回族女子，按照《大清律》来说，这四个女子也不算从犯，因此左宗棠在了解了她们的身世之后就将她们放了回去，并让她们自行婚配。

在阿古柏的儿子之中有一个叫做引上胡里的，他为人非常残暴，就算战败了也根本不服清军的管教，在狱中经常闹事，为了震慑其他阿古柏的同伙，左宗棠决定将引上胡里处以极刑来震慑他人，而他的几个儿子和女儿在目睹了引上胡里的下场之后，竟因为这件事而吓得有了心理阴影，在这之后相继死去。

剩下的儿子之中，阿古柏的第四子、第八子，第九子还有一个三岁的孙儿，由于年纪太小故而并未杀死他们，不过慈禧太后当时想着将他们施加“宫刑”进行惩戒，

又是左宗棠出面，念在几人年幼也饶过他们一劫，不过“死罪可免，活罪难饶”，这几个年幼的孩子之后在监狱中渡过了一生。

可以说左宗棠对阿古柏的后代处理的颇为完善，不过这更大功绩在于他收复了新疆，也让中国内地无后顾之忧安心发展，所以相比起曾国藩和李鸿章，左宗棠的功绩是两人远远不及的。